进化基因组学与系统生物学
——Evolutionary Genomics and Systems Biology
作者: Gustavo
Caetano-Anollés
出版: Wiley-Blackwell
索书号: Q7/E93/2010/Y
随着基因组学科的发展和基因组数据的积累,如何从大量的数据中挖掘单个基因以及多基因调控网络的生物学功能已成为后基因组时代面临的重要任务。进化基因组学是以基因组数据为基础,应用进化生物学手段在基因组水平上研究基因功能,寻找基因起源、发展和进化规律的一门学科。如果我们综合、权威地看待后基因组学里面的新兴领域,就会发现进化基因组学是其中一个试图揭示生物复杂性的日渐重要的复合领域。
《进化基因组学与系统生物学》于2010年由Wiley-Blackwell 出版社出版,Gustavo
Caetano-Anollés主编,全球一流专家共同贡献。Gustavo
Caetano-Anollés是伊利诺伊州伊利诺伊大学厄巴纳 - 香槟分校作物科学系教授。 他在DNA技术和基因组学相关领域拥有150多个原始引用研究出版物,并拥有美国DNA科学和生物技术的各个领域中一半的专利。
《进化基因组学与系统生物学》是一本具有首创性的教材,它创新性地将生物信息学、发育学、基因组学、结构生物学的既有的和新建立的概念整合到网络系统生物学一体化观点当中去。进化基因组学与系统生物学这门学科的三个重要方向是:研究基因组的历史,在基因组水平上理解有机体的进化;大分子补体的研究,包括这些推进生命活动的蛋白质和RNA生物大分子机器的进化;在基因组的背景下研究生物大分子交互作用的进化和动态进化。本书一共有20个章节,分为三大部分叙述,分别是:生命的进化;分子的进化;生物网络的进化。生命的进化包括第一到六章;分子的进化包括第七到十六章;生物网络的进化包括第十七章到二十章,三个部分层层深入,循序渐进,由浅入深地阐述了进化基因组学的研究内容。
《进化基因组学与系统生物学》作为一本以生物信息学为主的多学科教科书,具有以下一些特点:
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在系统生物学的框架内,对种系基因组学,基因组的进化,生物网络的演化进行了扎实和综合的介绍。
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有关RNA的生物学专题——RNA的翻译,结构进化,以及microRNA和基因表达的调控。
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本书的各个章节涉及到从基因型到表型、信息学在生物学中的作用、蛋白质结构和生物学功能、染色体重拍、生物网络与疾病。
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本书分三个部分,每个部分都由该领域的顶尖科学家编写。
总之,《进化基因组学与系统生物学》作为一本涉及基因组学、生物信息学、进化学、结构生物学、复合体生物学、生命起源、系统生物学、物种多样性等多方面学科的教材,适合广大师生阅读和参考,同时,由于书中内容与化学、物理学、计算机科学和工程学有交叉,因此同样可以作为这些领域与生物科学的交叉参考书。
目录
第一部分
生命的进化
第一章 进化基因组学的发展
第二章 第二章
重建系统进化的方法
第三章 生命树以及物种共同的祖先
第四章 第四章
真核生物的进化
第五章 细菌基因组进化中信息的作用
第六章 第六章
酵母的基因组进化
第二部分
所有分子的进化
第七章 基因组进化中的基因型和表现型研究
第八章 基因组进化中的蛋白质结构研究
第九章 基因组进化中的染色体重排
第十章 基因组进化中的分子结构研究
第十一章 蛋白质合成花费的进化研究
第十二章 作为进化单位的蛋白质域
第十三章 蛋白质的功能进化中的结构域家族分析
第十四章 非编码RNA
第十五章 MicroRNAs 及其它小RNA的进化基因组学
第十六章 RNA 结构的生物系统发生:进化方向和早期生物化学以及生物多样性的产生
第三部分
生物网络的进化
第十七章
进化网络的研究
第十八章 代谢网络的进化
第十九章
单基因和全基因组的重复以及蛋白和蛋白相互作用的研究
第二十章
生物大分子结构、功能、调控网络进化中的模块性与分散性问题
(武汉大学生命科学学院研究生 刘杰)