生物信息学和生物标记发现:个性化医学的基本数据分析

Bioinformatics and Biomarker discovery: “omic” data analysis for personalized medicine

 

作者:Francisco Azuaje

出版:John Wiley & Sons,Ltd

索书号:  Q811.4/A997/2010/Y

藏书地点: 武大外教中心

 

     生物信息学(Bioinformatics)是在生命科学的研究中,以计算机为工具对海量生物信息进行储存、检索和分析的科学,其研究重点主要体现在基因组学(Genomics)和蛋白质组学(Proteomics)两方面,具体说就是从核酸和蛋白质序列出发,综合利用生物学,计算机科学和信息技术来分析序列中表达的结构功能的生物信息,从而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。生物标记(Biomarker)是近年来随着免疫学和分子生物学技术的发展而提出的一类与细胞生长增殖有关的标志物。生物标记不仅可从分子水平探讨发病机制,而且在准确、敏感地评价早期、低水平的损害方面有着独特的优势,可提供早期预警,很大程度上为临床医生提供了辅助诊断的依据。

《生物信息学和生物标记发现》一书旨在向生物学家、临床医生和计算机科学研究者介绍生物信息学数据分析的基本原理,并介绍生物标记相关的基本技术和工具。该书的作者Francisco Azuaje博士在计算机科学,医疗信息学和生物信息学领域有超过十五年的研究经验。他参与了许多国家级或者国际级的研究项目,目前在卢森堡的一家心血管研究实验室主持翻译生物信息学和系统生物学的研究。他曾经是物理和电脑科学,工程和生物医学科学领域内一些杂志和科学会议的编委会成员,并在报刊、书籍和杂志上发表过多篇论文。Azuaje博士还是IEEE的一名副总编,他参与编辑的书籍有《Data Analysis and Visualization in Genomics and Proteomics》,《Artificial Intelligence Methods and Tools for Systems Biology》和《Advanced Methods and Tools for ECG Data Analysis》等。

《生物信息学和生物标记发现》一书一共包含十章,全面且详细地介绍了什么是生物信息学和生物标记,它们的应用有哪些,它们未来的发展趋势是怎样的;提供了生物标记发现研究中评估生物信息学的局限性,优势和挑战的基本原理和方法;讨论了系统生物学的方法和应用。该书主要是向读者介绍如何用基本的统计学和数据挖掘方法来进行生物标记的发现和其价值的评估,并重点介绍不同类型的基本数据的应用。该书也讨论了疾病筛选,诊断和预防等应用所包含的设计因素,应用要求和实用技术。

生物信息学家和电脑生物学家有责任发明、改进和优化电脑科学方法为疾病的检测,预防和治愈提供技术支持。为了完成这样的使命,生物信息学家就必须不断地学习新知识来完善自己的科研技能。该书正是为了这样的目的而出版,它向读者介绍了生物信息学和生物标记研究的主要困难,工具和机遇。通过阅读该书,读者朋友可以获得疾病生物标记研究所需的相关知识,包括如何评估应用要求,如何用电脑分析数据等。

该书的最大特点是邀请了许多客座专家对书中的重点章节撰写评论。评论包括对特殊类型的基本数据及其整合从方法学上和应用上进行详尽的讨论。讨论对象涵盖了当前在生物标记发现上广泛使用的主要数据资源。客座专家根据自身的科研实践经验,重点讨论了一些概念,设计原理和方法学方面的前沿知识,他们强调的这些前沿理论知识在未来很可能转变成更为具体的应用。

目录

作者和客座撰稿人传记

致谢

前言

1 生物标记和生物信息学

2 基本统计概念回顾

3 基于生物标记技术的预测模型:设计和口译原理

4 基因型-表形关联发现和分析的简介

5 生物标记和基因表达数据分析、

6 用于发现生物标记的蛋白质组学和代谢组学:光谱数据分析简介

7 疾病生物标记和生物互作网络

8 用于发现生物标记的综合数据分析

9 发现生物标记的信息资源和软件工具

10 生物信息学和发现生物标记的挑战和研究方向

                                    (  武汉大学生命科学学院研究生     刘杰