MicroRNA研究方法

-----MicroRNA Methods

 

作者:   John J.RossiGregory J.Hannon

出版:    科学出版社

索书号:  Q522/M626r/2008/Y

ISBN:     978-7-03-021477-5

藏书地点: 武大外教中心

 

MicroRNA是一类长度在21个核苷酸左右的单链小分子RNA,它主要通过与相关蛋白质形成RNA诱导沉默复合体来抑制靶基因mRNA的翻译,从而导转录后基因的表达调控。虽然第一个microRNA lin-4是美国科学家于1993年在线虫中发现的,但是直到2001年人们在线虫、果蝇和人类等动物细胞中鉴定出近百种与lin-4类似的小分子非编码RNA存在,才正式命名这类小分子为microRNA。随后,在其他动物、植物甚至病毒中也相继发现了大批microRNA,揭示出在生物细胞中一个庞大的调控RNA世界。

研究表明,microRNA在动植物的生长、发育、分化、生殖等生理过程中发挥着重要的作用,特别是microRNA的表达异常与人类疾病形成密切相关,如在肿瘤和癌症中某些microRNA扮演着癌基因或者抑癌基因的角色。这些发现引起了全世界的关注,对microRNA等小分子非编码RNA的搜寻及其功能的探索一度成为生命科学的研究热点和前沿,并连续三年被Science杂志评为年度十大科技突破。

MicroRNA研究方法》一书于2008年由科学出版社出版,作者John J.RossiGregory J.Hannon。本书是酶的方法》系列丛书最新一卷,同时也是最新的关于microRNA研究的方法学专著,本书的两位主编分别来自美国加州生物科学研究所和贝克曼研究所,以及美国冷泉港实验室,他们都是RNA干扰领域的知名专家。参与编写本卷的34位作者分别来自不同国家的13个研究小组,他们均在microRNA研究的某些方面取得过突破性成果。

MicroRNA研究方法》一书,在内容选材方面着重突出了生物信息学在microRNA研究中的重要作用。生物信息学是计算机技术延伸到生物学研究而诞生的一门新兴学科,近年来,计算机RNA组学已经成为生物信息学的一个重要组成部分。本书第一部分如第124 章详细介绍了生物信息学在microRNA候选基因识别和靶基因预测等方向应用的原理以及所涉及的问题,并就如何利用计算机预测方法结合各种实验用于microRNA研究这一问题,提供了详细的方案。这也是目前关于计算机方法在microRNA研究中应用的基础最全面的研究指南。

MicroRNA研究方法》一书有以下几个方面的特点:

1、全面性。本书介绍的研究方法涵盖目前microRNA研究的各个方面,从microRNA的初步预测和鉴定、表达分析,进一步到microRNA的生物发生、加工机制、表达调控,再到microRNA与发育、分化、疾病的关系等功能研究,读者可全面把握microRNA研究的各种方法。本书同时也是一本非常全面的microRNA研究综述。在每一章的开始,作者通过简练而精要的概述,引荐了众多microRNA研究的经典文献和近两年发表的重要论文,介绍了相关的研究内容与方法、研究者以及重要结果。

2、逻辑性。本书将目前microRNA的研究归纳为逐步深入的三个方面:1microRNA及其靶基因的鉴定。2. microRNA的表达、成熟和功能分析。3. microRNA与疾病,这三个方面以microRNA发现的历史为逻辑顺序,也是所有microRNA研究由浅入深的必经之路。

3、科学性。本书针对各个方向基础和最主要的问题,展示了不同研究者解决同类问题的不同策略和方法,并以实际研究方案和详细实验数据作为例证,通过类比分析显示出不同方法的侧重点和优缺点,集众家所长。

4、实用性。本书详细介绍了关于microRNA分子各种研究方法的原理和实验操作,其中包括操作时使用的试剂配方和具体的实验条件。读者可以参考本书所讲述的试验方法及操作来进行相关的科研工作。

5、另外,作为方法学著作,它不但重视方法步骤,更强调设计方法的原理和该方法相关的问题,这是本书的一大特色。

总的说来,MicroRNA研究方法》是一本针对性极强的生物学工具书,具有科学性、系统性和实用性,是MicroRNA研究工作者的良师益友。近年来,随着国内MicroRNA研究的逐步兴起,从事该方向研究的人员与日俱增,引进本书显得尤为及时和重要。本书的引进必将推动国内RNA科学研究的发展,由此对整个生命科学领域起到带动作用并产生深远影响。

 

本书目录:

前言

MicroRNA及其靶标的鉴定

第一章   病毒MicroRNA的鉴定

第二章   应用鲁棒性机器学习算法预测MicroRNA基因及其靶标

第三章   病毒编码MicroRNA的鉴定

第四章   MicroRNA靶标预测的计算机方法

MicroRNA的表达、成熟与功能分析

第五章   Dorsha复合体活性的体外和体内检测

第六章   MicroRNA基因表达的基因芯片分析

第七章   哺乳动物细胞MicroRNA的克隆与表达检测

第八章   体外与体内研究MicroRNA和小干扰RNA甲基化的方法

第九章   发育过程中小RNA表达谱的分析

第十章   T细胞发育过程中MicroRNA导的基因调控与功能

MicroRNA与疾病

第十一章 白血病与淋巴瘤MicroRNA表达异常的研究

第十二章 植物中受病理调控的小RNA的发现

第十三章 病毒MicroRNA表达与功能分析的实验方案

 

索引

 

 

(武汉大学生命科学学院研究生  张英)