-----Bioinformatics:Sequence and Genome
Analysis
出版： 科学出版社
索书号： Q3/M928/2006/Y
藏书地点： 武大外教中心
生物信息学是在生命科学的研究中，以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一，同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一。其研究重点主要体现在基因组学（Genomics）和蛋白质组学（Proteomics）两方面，具体说就是从核酸和蛋白质序列出发，分析序列中表达的结构功能的生物信息。
生物信息学经历了三个阶段：前基因组时代（20世纪90年代前） 这一阶段主要是各种序列比较算法的建立、生物数据库的建立、检索工具的开发以及DNA和蛋白质序列分析等。基因组时代（20世纪90年代后至2001年）
这一阶段主要是大规模的基因组测序，基因识别和发现，网络数据库系统地建立和交互界面工具的开发等。后基因组时代（2001至今）
随着人类基因组测序工作的完成，各种模式生物基因组测序的完成，生物科学的发展已经进入了后基因组时代，基因组学研究的重心由基因组的结构向基因的功能转移。这种转移的一个重要标志是产生了功能基因组学，而基因组学的前期工作相应地被称为结构基因组学。
《生物信息学—序列与基因组分析》一书的主要研究方向是序列与基因组分析，序列比对（Sequence Alignment）的基本问题是比较两个或两个以上符号序列的相似性或不相似性。基因识别的基本问题是给定基因组序列后，正确识别基因的范围和在基因组序列中的精确位置。非编码区由内含子组成（introns），一般在形成蛋白质后被丢弃，但从实验中，如果去除非编码区，又不能完成基因的复制。显然，DNA序列作为一种遗传语言，既包含在编码区，又隐含在非编码序列中。分析非编码区DNA序列没有一般性的指导方法。
对基因组测序、蛋白组学和芯片技术等产生的数据进行计算分析是及其重要的。《生物信息学—序列与基因组分析》这本书为分析DNA、RNA、和蛋白质数据提供了详尽的计算方法上的指导，它不仅解释了每一种方法的优缺点和背后算法，而且还提供了解决生物问题的策略。
《生物信息学—序列与基因组分析》一书于2006年由科学出版社出版，作者Gavid
W.Mount。基于作者Gavid
W.Mount在亚利桑那大学教授的高级课程，本书的前一版在全世界广泛用作教科书。为了更好适应本科生和研究生的教学，第二版进行了大范围修订。
《生物信息学—序列与基因组分析》一书共分成十三个章节，具体内容包括：历史简介与概论
、从实验室搜集和存储序列、校准与序列配对 、序列比对数据分析和可能性简介 、多重序列比对 、从序列数据库搜取相似序列 、 系统发生的预测、 预测RNA的二级结构、基因预测与调控、 蛋白分类与结构预测、基因组分析、使用Perl和Perl模块进行生物信息分析、微数列分析。
《生物信息学—序列与基因组分析》一书作为生物信息学专业研究读物，是生物学和计算机学科的综合书籍，观点新颖独到，内容饱满详实、语言浅显易懂，除此之外，还包括一些其他的特点：
1、章节更新和修订：为表达得更清晰易懂，一些设计序列比对、结构预测、进化和基因预测、数据库搜索和基因组分析的章节已经更新并重写。
2、新增章节：增加了使用perl和BioPerl模块进行生物信息学编程，以及对芯片数据进行统计分析的章节。
3、在线支持增强：额外资料，如问题列表、程序示例和附加材料等，都已提供在本书站点上。
4、对教学有用的新改进：以下有助于教师和学生更好的使用本书：
—简明引言：对每张的背景和内容都做了简洁介绍
—章节必会：对每章里学生应该掌握的概念和技术做了小结
—专业词汇：定义每张中的专业词汇
—问题列表：教师可用这些问题来测试学生对每一章节概念和技术的理解掌握程度
—实用案例：描述如何应用计算机技术来解决现实送的生物学问题
总的说来，《生物信息学—序列与基因组分析》一书对本科生和研究生来讲，本书将是一本理想的基础教科书。同时它也高度实用与自学人群，如那些喜欢应用计算机分析方法术的科研人员以及那些学术和工业实验室里的信息技术专家们。
本书目录：
前言
第一章 历史简介与概论
第二章 从实验室搜集和存储序列
第三章 校准与序列配对
第四章
序列比对数据分析和可能性简介
第五章 多重序列比对
第六章 从序列数据库搜取相似序列
第七章 系统发生的预测
第八章 预测RNA的二级结构
第九章 基因预测与调控
第十章 蛋白分类与结构预测
第十一章 基因组分析
第十二章 使用Perl和Perl模块进行生物信息分析
第十三章 微数列分析
索引
（武汉大学生命科学学院研究生 张英）