生物信息学:基因组生物信息学和计算生

物学

­——Bioinformatics:Genome Bioinformatics and Computational Biology

 

    者:Renu Tuteja

    版:NOVA

号:Q811.4/b615t/2012/Y

ISBN   9781621009139

藏书地点:武大外教中心

 

生物信息学Bioinformatics)是在生命科学的研究中,以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一,同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一。其研究重点主要体现在基因组学(Genomics)和蛋白质组学(Proteomics)两方面,具体说就是从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中表达的结构功能的生物信息。

计算生物学是指开发和应用数据分析及理论的方法、数学建模、计算机仿真技术等。当前,生物学数据量和复杂性不断增长,每14个月基因研究产生的数据就会翻一番,单单依靠观察和实验已难以应付。因此,必须依靠大规模计算模拟技术,从海量信息中提取最有用的数据。相对于生物信息学,计算生物学的层次更高。虽然两者之间界限模糊,但生物信息学略微偏向于生物而计算生物学略微偏向计算机。生物信息学侧重于数据的提取、挖掘,而计算生物学侧重对数据的处理、运用。计算生物学的最终目的不只局限于测序,而是运用计算机的思维解决生物问题,用计算机的语言和数学的逻辑构建和描述并模拟出生物世界。

《生物信息学:基因组生物信息学和计算生物学》2012年由Nova Science Publishers出版社出版。作者为Renu Tuteja,她是印度遗传工程国际研究中心的科学家。本书讲述了最近时间段内世界各地与生物信息学和计算生物学有关的科学研究。

生物信息学是计算机科学,信息科技和生物学交叉的科学。它将计算机科学和信息科技应用到生物学和生物生态系统中。对于我们理解生物学过程,生物信息学是一个非常有用的工具。在过去几年的时间里,生物信息学已经有了很快速的发展,发展出了很多新的方法去解决复杂的生物学问题。生物信息学将分子生物学和计算机科学融合在一起,利用基因组的信息去鉴定人类的疾病,发现新的药物作用靶标。生物信息学在本领域已经得到了非常广泛的应用,它的主要领域集中在基因的发现、基因组的组装、药物的设计和发现以及基因组范围内相互作用的分析研究。生物信息学现在已经用来解决一些涉及关键细节的问题,包括:解释和分析大量的数据(如:核酸和氨基酸序列、蛋白质结构域和蛋白质结构)。解释和分析数据的过程通常被称为计算生物学。本书告诉了我们生物信息学和计算生物学在生物学各种各样的场景中都有着非常重要的作用。

本书从组学水平到分子水平,从计算科学到生物学,非常详细的讲述了生物信息学在生物学各个领域的应用。

《生物信息学:基因组生物信息学和计算生物学》一书内容饱满详实,除此之外,还包括一些其他的特点:

1、具有实用性和针对性。《生物信息学:基因组生物信息学和计算生物学》一书内容广泛、描述简洁,在编写的过程中,所有的章节都如同一份完整的实验记录或用户手册。然而,整本书以生物信息学为中心,编写的中心明确,具有实用性和针对性。

2、案例丰富。该书在在前面几章介绍了基本的概念,在概念之中常常穿插介绍实际案例,这些特殊的案例便于读者参考书中的研究与应用,使该书籍更具有参考价值。

3、图文并茂。《生物信息学:基因组生物信息学和计算生物学》在编写的过程中配有大量插图,图文并茂,不仅让读者在阅读过程中更加清晰明了,还能增加读者阅读的趣味性。

4、条理清晰。在该书的末尾设有主题词索引,将出现的相关比较重要的词汇都罗列出来,并予以注释在文中的页码,供读者快速寻找感兴趣的内容进行阅读。这大大方便了读者在阅读该书之时对词汇的掌握和搜寻。可以激发学生的学习兴趣或者为想要了解相关知识的人员提供了途径。

总的说来,《生物信息学:基因组生物信息学和计算生物学》是一本出色的生物信息学参考书籍。

目录

1. 毛竹基因组中的重复DNA序列及其在基因组进化中的分析

2. 转录网络:信息流的动态变化

3. 通过整合蛋白二级结构的预测鉴定亮氨酸的重复序列

4. 利用生物信息学分析人类肿瘤形成过程的小RNA

5. 人类生物银行和人类遗传数据库——生物技术的规模

6. 第二代DNA测序在医学研究中的应用

7. 种系基因组学

8. 转座子

9. 抗癌中草药结合机制的深入分析

10. 癌症种系遗传学:肿瘤进化的计算模型

 

 

 

武汉大学生命科学学院研究生 王鑫