生物信息学：基因组和后基因组

——Bioinformatics:Genomics and post-genomics

作 者：Frédéric Dardel, François Képès

出 版：Wiley

索 书 号：Q881.4/D216/2006/Y

ISBN ：0470020016

藏书地点：武大外教中心

生物信息学(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、处理、存储、传播，分析和解释等各方面的学科，也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展，生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。它通过综合利用生物学，计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。

基因组，Genome，一个细胞或者生物体所携带的一套完整的单倍体序列，包括全套基因和间隔序列。可是基因组测序的结果发现基因编码序列只占整个基因组序列的很小一部分。因此，基因组应该指单倍体细胞中包括编码序列和非编码序列在内的全部DNA分子。说的更确切些，核基因组是单倍体细胞核内的全部 DNA分子。线粒体基因组则是一个线粒体所包含的全部DNA分子。叶绿体基因组则是一个叶绿体所包含的全部DNA分子。

后基因组时代，亦称功能基因组学时代。它以提示基因组的功能及调控机制为目标，其核心科学问题主要包括：基因组的多样性，基因组的表达调控与蛋白质产物的功能，以及模式生物基因组研究等。它的研究将为人们深入理解人类基因组遗传语言的逻辑构架，基因结构与功能的关系，个体发育、生长、衰老和死亡机理，神经活动和脑功能表现机理，细胞增殖、分化和凋亡机理，信息传递和作用机理，疾病发生、发展的基因及基因后机理（如发病机理、病理过程）以及各种生命科学问题提供共同的科学基础。

《生物信息学：基因组和后基因组》由Wiley出版社在2006年9月出版，由Frédéric Dardel, François Képès共同编写。Frédéric Dardel来自巴黎第五大学药学院，François Képès负责Genopole公司负责表观基因组项目。本书最后是由Noah Hardy翻译成英文版本。

《生物信息学：基因组和后基因组》一书应用非常出色的篇章介绍了生物信息学在分析基因组和后基因组数据中的应用。本书翻译自最初的法国版本。在帕莱索的巴黎综合理工大学，本书一直被作为教材进行讲授。本版本得到了作者进一步的修正和升级。

本书在开篇简单的介绍了基因的结构和序列测定之后，主要讲述应用相关的技术鉴定基因，鉴定蛋白编码序列和调节区域。书中讨论了比较基因组的方法学，应用已知物种的序列信息去推断未知序列的信息。书中专门有一章介绍结构的预测，包括了RNA和蛋白质。之后本书庙会了在细胞中的RNA和蛋白网络，以及它们之间的相互作用。结尾，作者讨论了如何应用类似的方法去建立起互作网络的模型。

《生物信息学：基因组和后基因组》一书作为介绍新技术新方法的综合学科书籍，介绍生物信息学在基因组和后基因组分析中的应用，内容饱满详实，除此之外，还包括一些其他的特点：

1、具有实用性和针对性。《生物信息学：基因组和后基因组》一书内容广泛、描述简洁，在编写的过程中，所有的章节都如同一份完整的实验记录或用户手册。然而，整本书以基因组为中心，然后延展到后基因组，RNA和蛋白质的相关内容，编写的中心明确，具有实用性和针对性。

2、案例丰富。书中在介绍生物信息学的应用时，举了很多在实际工作中的例子，让读者可以更加具体的了解每个方法在应用中的注意事项和相关的细节，让文章的内容不再抽象晦涩。

3、图文并茂。《生物信息学：基因组和后基因组》在编写的过程中配有大量精美的插图，如基因组的结构，RNA的结构形态以及相关操作的界面，图文并茂，不仅让读者在阅读过程中更加清晰明了，还能增加阅读的趣味性。

4、条理清晰。在该书的末尾设有主题词索引，将出现的相关比较重要的词汇都罗列出来，并予以注释在文中的页码，供读者快速寻找感兴趣的内容进行阅读。这大大方便了读者在阅读该书之时对词汇的掌握和搜寻。可以激发学生的学习兴趣或者为想要了解相关知识的人员提供了途径。

总的说来，《生物信息学：基因组和后基因组》是一本出色的生物信息学教材，介绍来了生物信息学在基因组，RNA，蛋白质水平的实际应用，同时提出了新颖的方法进一步改进相关的技术。对于生物学专业的老师和研究者来说，都是一本非常专业的参考书目。

目录：

第一章 基因组测序

第二章 序列比对

第三章 比较基因组学

第四章 遗传信息和生物序列

第五章 统计和测序

第六章 结构预测

第七章 转录组和蛋白组：大分子网络

第八章 类型模拟

武汉大学生命科学学院研究生 王鑫