内在无序蛋白质 (IDPs)

——Intrinsically disordered proteins (IDPs)

 

    者:Violet Weber

    版:Nova Science Pub Inc

号:Q51/I-61w/2016/Y

ISBN   978-1-63484-407-9

藏书地点:武大外教中心

 

无序蛋白质(Intrinsically disordered proteinsIDPs)是一种缺乏固定或有序三维结构的蛋白质。无序蛋白质广泛参与信号传递、DNA转录、细胞分裂和蛋白质聚集等重要的生理与病理过程。它们通常具有序列重复性高、高亲水性与带电性及编码基因序列简单的结构特征,同时还具有易结合、空间优越性和高度协调性的生物学优势。无序蛋白质的发现是对传统的蛋白质“序列-结构-功能”范式的挑战。天然无序蛋白是一类缺乏固定或有序三维结构的蛋白。天然无序蛋白涵盖一系列各种状态的蛋白,包括完全没有固定有序结构,到有部分结构,也包括随机螺旋、熔球(前体),以及由可折叠接头连接起来的多个蛋白结构域。它们组成了一个蛋白的主要类别(其他主要类别包括球蛋白、纤维蛋白,以及膜蛋白)。尽管不具有高级结构,但无序蛋白是有功能的,其功能的最主要体现者是伴侣分子。

IDPs涵盖了从完全非结构化到部分结构化的一系列状态,包括随机线圈、(预先)熔融球和由柔性连接体连接的大型多域蛋白。它们与球状蛋白、纤维蛋白和膜蛋白一起构成蛋白质的主要类型之一。IDPs的发现挑战了传统的蛋白质结构范式,即蛋白质功能依赖于固定的三维结构。这一理论在2000年和2010年受到来自结构生物学各个分支的越来越多的证据的挑战,这表明蛋白质动力学可能与这些系统高度相关。尽管idp缺乏稳定的结构,但它是一类非常大且功能重要的蛋白质。在某些情况下,IDPs在与其他大分子结合后可以采用固定的三维结构。总的来说,IDPs与结构蛋白在许多方面都有不同,在功能、结构、序列、相互作用、进化和调控等方面具有不同的性质。

《内在无序蛋白质》一书于2016年由Nova Science Pub Inc出版,编辑为Violet Weber《内在无序蛋白质》一书详细地介绍了无序蛋白质的一些特点,强调了DNA结合的无序蛋白质的特征,同时阐述了无序蛋白质的结构分析方法,包括计算机自动模拟等建模分析。同时,该书还分析了无序蛋白质及其复合物的生物物理表征,引出无序蛋白质研究的过程中即将遇到的挑战与矛盾。《内在无序蛋白质》回顾了无序蛋白质的发展,旨在为从事相关研究的学者或对该领域感兴趣的人员,提供一个参考教材。

《内在无序蛋白质》一书共有三章。第一章DNA结合无序蛋白质。第二章无序蛋白质结构分析:计算机自动模拟。第三章无序蛋白质及其复合物的生物物理表征:挑战与矛盾。该书的每章都有相关领域的专家进行主笔,两位编辑进行审核和整理。本书对理论和实验之间的互相应用进行了阐释,同时对现在计算蛋白模型的状态进行了展示,让研究者可以用计算的方法把他们的研究整合成一个整体。本书主要的内容集中在两个方面。本书回顾了无序蛋白质的发展。同时也展示了在无序蛋白质中让人着迷的重要的实验结果。虽然两部分内容可以联系起来,但作者并没有刻意的去把两个方面整合在一起。

《内在无序蛋白质》一书是融合了多学科的一本理论和实验相呼应的书籍,内容饱满详实,语言精准,除此之外,还包括一些其他的特点:

1、该书用很大的篇幅来介绍内在无序蛋白质的相关概念和信息,而且介绍了全新的技术路线对内在无序蛋白质的分析。

2、图文并茂,使本书充满趣味性。本书在几乎所有章节都应用了图和表的形式对观点进行说明,许多抽象概念很容易用图片描绘。

3、本书的语言优美。与大多数的科学类书籍相比,本书的语言应用非常精致。一般的科学类图书都是观点和数据的堆砌,读者读起来会感觉晦涩干瘪。本书的文字在阐明观点的同时,让读者有读散文的感觉,轻松愉悦。

4、《内在无序蛋白质》的末尾设有主题词索引,将出现的相关比较重要的词汇都罗列出来,并予以注释在文中的页码,供读者快速寻找感兴趣的内容进行阅读。这大大方便了读者在阅读该书之时对词汇的掌握和搜寻。可以激发学生的学习兴趣或者为想要了解知识的人员提供了途径。

总的来说,《内在无序蛋白质》是本领域顶尖研究者成果的合集,从多个主题展示了内在无序蛋白质现阶段的研究成果,随着结构信息,理论和计算的不断发展,他们在这个领域起着越来越重要的作用。本书总结了近来在本领域实验和理论的发展,让读者第一时间了解到内在无序蛋白质发展的信息。《内在无序蛋白质》既是一本实验知道教程,也是一本内在无序蛋白质的综述教程。

 

 

目录

前言

1.   DNA结合无序蛋白质

2.   无序蛋白质结构分析:计算机自动模拟

3.   无序蛋白质及其复合物的生物物理表征:挑战与矛盾

索引

 

 

(武汉大学生命科学学院研究生 李丛