生物信息学—计算观点
----- BioInformatics: A Computing Perspective
作者： Shuba Gopal, Anne Haake, Rhys Price Jones, Paul Tymann
出版： McGraw-Hill
Education
索书号： Q811.4/B615g/2009/Y
藏书地点： 武大外教中心
生物信息学是在生命科学的研究中，以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一，同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一。其研究重点主要体现在基因组学和蛋白质组学两方面，具体说就是从核酸和蛋白质序列出发，分析序列中表达的结构功能的生物信息。
生物信息学经历了三个阶段：前基因组时代（20世纪90年代前） 这一阶段主要是各种序列比较算法的建立、生物数据库的建立、检索工具的开发以及DNA和蛋白质序列分析等。基因组时代（20世纪90年代后至2001年）
这一阶段主要是大规模的基因组测序，基因识别和发现，网络数据库系统地建立和交互界面工具的开发等。后基因组时代（2001至今）
随着人类基因组测序工作的完成，各种模式生物基因组测序的完成，生物科学的发展已经进入了后基因组时代，基因组学研究的重心由基因组的结构向基因的功能转移。这种转移的一个重要标志是产生了功能基因组学，而基因组学的前期工作相应地被称为结构基因组学。
生物信息学基本上只是分子生物学与信息技术（尤其是因特网技术）的结合体。生物信息学的研究材料和结果就是各种各样的生物学数据，其研究工具是计算机，研究方法包括对生物学数据的搜索（收集和筛选）、处理（编辑、整理、管理和显示）及利用（计算、模拟）。
《生物信息学—计算观点》一书的主要研究方向computing类别是概念，提出者是IBM，生物信息学：计算方法帮助学生熟悉生物科学的关键概念，熟悉当前的编程工具和方法。 它以一种吸引下一代科学家的方式成功地将有趣的计算挑战与有关的生物现象联系起来。生物信息学研究是利用数理统计、模式识别、动态规划、密码解读、语意解析、信令传递、神经网络、遗传算法以及隐马氏模型等各种方法，对序列、结构数据进行定性和定量分析，从中获取基因编码、基因调控、序列-结构-功能关系等理性知识，阐明细胞、器官和个体的发生、发育、病变、衰亡的基本规律和时空联系，探索生命起源、生物进化、生命本质等重大理论问题，最终建立“生物学周期表”。
《生物信息学—计算观点》一书于2009年由McGraw-Hill Education出版社出版，作者Shuba Gopal, Anne Haake, Rhys Price Jones, Paul Tymann。代表着各自领域的领先专家，致力于改善全球读者的生活，职业和兴趣。《生物信息学—计算观点》一书共九章，具体内容包括:路图；生物基础知识；潮湿和干燥的实验技术；碎片整理；序列比对；模拟进化模型；发现基因；基因表达；项目。研究方法包括以数据（库）为核心数据库的建立，生物学数据的检索，生物学数据的处理，生物学数据的利用：计算生物学。
《生物信息学—计算观点》这本书是由一个经验丰富的作家团队编写的，代表了生物信息学新兴学科出现的许多领域。他们的常识方法和仔细详细的生物信息学演示：计算的观点融合计算和生物科学在一个有吸引力和独特的方式。作为生物信息学专业研究读物，是生物学和计算机学科的综合书籍，观点新颖独到，内容饱满详实、语言浅显易懂，除此之外，还包括一些其他的特点：
1.本书讲述的是一些简单的生物计算方法，将信息学和生物学联系起来，构建生物模型，模拟生物进化。
2.本书没有从抽象的生物信息学讲起，而是先从生物基本知识讲起，在讲述计算，由浅入深，深入简出，易于理解。
3.在每个章节的最后，有专业术语列表，以及参考文献，便于感兴趣的读者查阅，帮助深入理解生物信息学。
4.本书最突出的特点：简明引言：对每张的背景和内容都做了简洁介绍；章节必会：对每章里学生应该掌握的概念和技术做了小结；专业词汇：定义每张中的专业词汇；问题列表：教师可用这些问题来测试学生对每一章节概念和技术的理解掌握程度；实用案例：描述如何应用计算机技术来解决现实送的生物学问题。
总的说来，《生物信息学—计算观点》一书对本科生和研究生来讲，本书将是一本理想的基础教科书。同时它也高度实用与自学人群，如那些喜欢应用计算机分析方法术的科研人员以及那些学术和工业实验室里的信息技术专家们。
本书目录：
前言
第二章：生物基础知识
第三章：潮湿和干燥的实验技术
第四章：碎片整理
第五章：序列比对
第六章：模拟进化模型
第七章：发现基因
第八章：基因表达
第九章：项目
索引
（武汉大学生命科学学院研究生 张英）