生物信息学：

下一代测序实用手册及其应用

——Bioinformatics：

A Practical Handbook of Next Generation Sequencing and Its Applications

作者：Lloyd LOW·Martti Tammi

出版：World Scientific Press

索书号：Q811.4/B615j /2017/Y

藏书地点：武大外教中心

生物信息学(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、处理、存储、传播，分析和解释等各方面的学科，也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展，生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。它通过综合利用生物学，计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。高通量测序技术（High-throughput sequencing）又称“下一代”测序技术（"Next-generation" sequencing technology），以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。

快速的技术发展导致了越来越有效的测序方法。新一代测序（NGS）越来越普遍，并且已经变得具有成本效益，产生需要分析的序列数据爆炸式增长。将计算分析应用于广泛应用的目标研究所需的技能，包括识别癌症的原因，疫苗设计，新抗生素，药物开发，个性化医疗和农业中更高的作物产量，都受到高度追捧。这本宝贵的书《生物信息学：下一代测序实用手册及其应用》提供了一步逐步指导复杂的主题，使读者可以轻松地从原始测序数据进行必要的分析，以回答重要的生物学问题。对于从事生物信息学课程和专业人士参考资料的教师来说，这是一本很好的动手材料。这些章节是独立，适合自学某些主题的读者。读者将获得从NGS平台处理测序数据所需的技能，从而使自己对需要熟练的生物信息学家处理大量数据的雇主更具吸引力。

这本书是介绍新一代测序的生物信息学分析数据的实用手册，覆盖所有主要的分析领域，从质量控制归并到特定于域的相关的练习，读者就能得到他想要的异调用和转录组等。这本书是因为这些联系变得高度实用。涵盖了分析测序数据。它是举办实践课程或研讨会的优秀资源。有经验的实践者希望尝试在不同领域的分代生物信息学的主要领域，使它适合初学者，但也适合生物学硕士、博士生物化学系助理教授等研究人员。本书的使用的语言对于非生物信息学家来说相对容易理解。在描述复杂概念时已经成功地进行了充分的简清晰性。

《生物信息学：下一代测序实用手册及其应用》一书所涵盖的内容将支持广泛的应用领域：最后一章提出了一些可能性。但显然每个读者都必须自己解自己研究领域特有的挑战。而这本书将作为进一步构建技术的基础。值得称赞的是，它促进了一个组织良好的分析工具流程的定义，并为基因组学工作的质量赋予了意义—非常重要却常常被低估：进行GWAS—或构建系统发育—没有首先恰当地评估依赖哪些数据和抛弃哪些数据，将总是导致无用或错误的结果。

除此之外，《生物信息学：下一代测序实用手册及其应用》还具有以下几个特点：

1、具有权威性和时效性。《生物信息学：下一代测序实用手册及其应用》一书所涵盖的内容将支持广泛的应用领域，语言描述简洁，本书的编者是基因组学领域长期的教学和研究学者，因此书本具有较大的权威性。同时，由于关于生物学的内容更新换代很快，很多内容可能仅限于编书的当时，随着时代的发展有了更多的补充，因此，本书内容具有时效性。

2、层次鲜明，脉络清晰。《生物信息学：下一代测序实用手册及其应用》分成了十个章节，每个章节都是独立的知识点，将书本的内容非常清晰的编排出来，具有鲜明的层次和清晰的脉络。

3、图文并茂，便于理解。书本中运用了大量的图片，因此这种图文并茂的方式使整本书更具有可读性、趣味性。

4、编排紧凑。该书在每一章开头都以提要和简介引入本章要讲的主要内容作为这一章的提纲挈领，并在章节末尾处对内容进行总结，并给出了关键词的解释，帮助读者对书中内容和概念进行归纳梳理，并自主进行扩展阅读。

总的来说，《生物信息学：下一代测序实用手册及其应用》内容详实、语言生动，图文并茂，趣味性强，它适合初学者，但也适合生物学硕士、博士生物化学系教授等研究人员阅读，是他们不可或缺的科学指南。

前言

引言

第一章下一代测序技术简介

第二章 Linux操作系统简介

第三章序列质量检测

第四章序列对齐读取

第五章建立研究工作流程

第六章基因组的从头组装

第七章外显子组测序

第八章转录组

第九章宏基因组

第十章 NGS数据的应用

索引

（武汉大学生命科学学院研究生王鑫）