生态和发育学的统计学模型的实例应用

——Case Application of Statistical Model in Ecology and Evolution

 

 

作者:Youhua Chen

出版社:NOVA publishers

索书号:Q141/C518/2016/Y

ISBN978-1-63484-876-3

藏书地点:武大外教中心

 

 

发育生物学(developmental biology)是一门研究生物体从精子和卵子发生、受精、发育、生长到衰老、死亡规律的科学。是生物科学重要的基础分支学科之一,研究内容是和许多其他学科内容相互渗透、错综联系,特别是和遗传学、细胞生物学、分子生物学的关系最为紧密。其应用现代科学技术和方法,从分子水平、亚显微水平和细胞水平来研究分析生物体从精子和卵的发生、受精、发育、生长直至衰老死亡的过程及其机理。发育生物学是一个多学科的研究领域,它利用一切有关学科的技术方法,也利用它们的研究成果,来研究和解释发育中的问题。要研究某一结构基因的调节控制,分子遗传学关于原核基因的研究就是不可缺少的基础。但是关于发育机制的探索,不能仅限于某一水平,既可以是分子水平的研究,也可以是亚显微或细胞水平的,如果涉及某些细胞器在细胞分化中的变化和作用;或者如果涉及到不同胚层的细胞在形成某一特定结构中的相互作用,就是更高水平的事。或者如果涉及个体的极性或对称等的形成,那就是个体水平的了。研究某种超微结构在发育中的变化,就要应用电子显微镜技术;研究某种蛋白的出现,细胞膜受体等可能需要免疫学技术,如果要离体地研究某种细胞的终末分化,或者不同组织在形成某种构造中的相互作用,就离不开细胞培养或组织培养的技术,显然,在哪个水平上工作,或者研究什么问题,决定了采用什么技术。

生态位(ecological niche)是指一个种群在生态系统中,在时间空间上所占据的位置及其与相关种群之间的功能关系与作用。生态位又称生态龛。表示生态系统中每种生物生存所必需的生境最小阈值。两个拥有相似功能生态位、但分布于不同地理区域的生物,在一定程度上可称为生态等值生物。生态位的概念已在多方面使用,最常见的是与资源利用谱(resources utilization spectra)概念等同。所谓“生态位宽度”(niche breadth)是指被一个生物所利用的各种不同资源的总和。在没有任何竞争或其它敌害情况下,被利用的整组资源称为“原始”生态位(fundamental niche)。因种间竞争,一种生物不可能利用其全部原始生态位,所占据的只是现实生态位(realized niche)。生态位概念应用于植物尚有一定困难。几乎一切植物都需要阳光进行光合作用,而且在陆地上倾向于占有环境的相同部分——土壤表面上下一定高度和深度。然而,植物种在自然环境水平地带和垂直地带中占据的区域以及在生长季节、开花季节等方面出现的差异,可与动物的生态位相比拟。生态位又称生态龛。表示生态系统中每种生物生存所必需的生境最小阈值。内容包含区域范围和生物本身在生态系统中的功能与作用。1924年由格林内尔(J.Gri-nell)首创,并强调其空间概念和区域上的意义。1927年埃尔顿(Charles Elton)将其内涵进一步发展,增加了确定该种生物在其群落中机能作用和地位的内容,并主要强调该生物体对其它种的营养关系。在自然环境里,每一个特定位置都有不同种类的生物,其活动以及与其它生物的关系取决于它的特殊结构、生理和行为,故具有自己的独特生态位。 如每一种生物占有各自的空间,在群落中具有各自的功能和营养位置,以及在温度、湿度、土壤等环境变化梯度中所居的地位。一个种的生态位,是按其食物和生境来确定的。如海星(pisaster ochraceus)在北美洲太平洋沿岸居于主要捕食者的龛位。按竞争排斥原理,任何两个种一般不能处于同一生态龛。在特定生态环境中赢得竞争的胜利者,是能够最有效地利用食物资源和生存空间的种,其种群以出生率高、死亡率低而有较快的增长。有着相似食物或空间要求的数群近缘种,因处不同生态位,彼此并不竞争。麦克阿瑟(R.H. MacArthur)的研究发现,北美洲东北部有5种鸣禽在针叶林里一起生活,都属于林莺属(Den-droica),均以昆虫为食,对营巢地点也有相似要求,但每一种鸣禽在取食和营巢行为上显示了复杂的差别和各自占据的生态位,至少在食物丰富时防止了竞争。

两个拥有相似功能生态位、但分布于不同地理区域的生物,在一定程度上可称为生态等值生物。生态位的概念已在多方面使用,最常见的是与资源利用谱(resources utilization spectra)概念等同。所谓“生态位宽度”(niche breadth)是指被一个生物所利用的各种不同资源的总和。在没有任何竞争或其它敌害情况下,被利用的整组资源称为“原始”生态位(fundamnental niche)。因种间竞争,一种生物不可能利用其全部原始生态位,所占据的只是现实生态位(realized niche)。生态位概念应用于植物尚有一定困难。几乎一切植物都需要阳光进行光合作用,而且在陆地上倾向于占有环境的相同部分——土壤表面上下一定高度和深度。然而,植物种在自然环境水平地带和垂直地带中占据的区域以及在生长季节、开花季节等方面出现的差异,可与动物的生态位相比拟。

《生态和发育学的统计学模型的实例应用》一书于2016年由NOVA publishers出版,作者是Youhua Chen

《生态和发育学的统计学模型的实例应用》一书是介绍生态和发育生物学统计模型的专业书籍,内容包括第一部分:实例应用无置换费雪z变换法对曼特尔统计量的显著性检验、随机物种改变和多位点β多样性指数:从模拟和经验BCI树衍生的数据集中得到的矛盾场景的比较空间和环境的社会水平β多样性和分区的变化之间的关系:BIC树社区作为一个研究实例区分生态位和中性过程:多样性分区统计方法中的问题和进一步的展望估计历史生物地理学中的祖先范围:基于最大可能性推理的可选范围演化模型的发展全球哺乳动物的进化枝年龄,物种丰富度和系统发生学多样性之间的关系中国大陆县域区位空间点格局分析:人为因素,气候波动和水资源可利用量之间的相互作用建立与测量不确定度相关的物种-区域关系的模型使用占用率-丰度关系来估计气候变化下的物种种群变化 ‘共存’:一个R软件来展现物种共存模型和分析健身等价提升了同时具有分散性和竞争性耦合的波动环境下的物种共存性。以及第二部分:用于计算和仿真的R代码附录。

《生态和发育学的统计学模型的实例应用》一书作为生物学专业研究读物,观点新颖独到,内容饱满详实、语言浅显易懂,除此之外,还包括一些其他的特点:

1、本书不仅仅是介绍生态和发育统计学的相关知识,还结合案例分析各个统计模型。使读者能够更加直观清楚的了解到统计学知识。

2、索引文献丰富,证明了这本书的知识性,真实性。而且,这些索引文献绝大部分都是最新研究,这就是这本书与世界最新研究同步,让读者全面了解该领域的前沿进展。

3、本书还具有很强的专业性,书中的每个章节都是由不同的专业研究人士提供,他们都是致力于该领域的最新研究,让我们在短时间内了解更全面,更专业的资料。

4、在本书的最后,将出现的专业词汇都罗列出来,并予以注解,大大方便了大家对阅读过程中对统计学研究的专业术语的认知。

5、本书最鲜明的特点就是,图片生动形象,语言浅显易懂。语言介绍的同时,附上可以说明问题的图片,本来复杂枯燥的遗产学知识变得简单易懂,增加了本书的趣味性,对于初学者有很大的帮助。

总的说来,《生态和发育学的统计学模型的实例应用》一书为想要了解生物统计学的人员提供了清晰的导读路径,作为统计学领域的一本前沿研究图书,是一本值得为想要涉足该领域的人员推荐的专业书籍。

 

本书目录

前言

Part 1 实例应用

章节1 无置换费雪z变换法对曼特尔统计量的显著性检验

章节2 随机物种改变和多位点β多样性指数:从模拟和经验BCI树衍生的数据集中得到的矛盾场景的比较

章节3 空间和环境的社会水平β多样性和分区的变化之间的关系:BIC树社区作为一个研究实例

章节4 区分生态位和中性过程:多样性分区统计方法中的问题和进一步的展望

章节5 估计历史生物地理学中的祖先范围:基于最大可能性推理的可选范围演化模型的发展

章节6 全球哺乳动物的进化枝年龄,物种丰富度和系统发生学多样性之间的关系

章节7 中国大陆县域区位空间点格局分析:人为因素,气候波动和水资源可利用量之间的相互作用

章节8 建立与测量不确定度相关的物种-区域关系的模型

章节9 使用占用率-丰度关系来估计气候变化下的物种种群变化

章节10 ‘共存’:一个R软件来展现物种共存模型和分析

章节11 健身等价提升了同时具有分散性和竞争性耦合的波动环境下的物种共存性。

Part 2 用于计算和仿真的R代码附录

附录1 费雪转换和模拟的R数据

附录2 模拟不对称的分散和共存的R数据

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索引