Intrinsically Disordered Proteins:Dynamics,Binding,and Function
作者:Nicola Salvi
出版:Academic Press
索书号:Q51/I-61e/2019/Y
ISBN: 978-0-12-816348-1
藏书地点:武大外教中心
天然无序蛋白质是一类新发现的蛋白质, 它们在天然条件下没有确定的三维结构, 却具有正常的生物学功能, 广泛参与信号传递、DNA转录、细胞分裂和蛋白质聚集等重要的生理与病理过程。它们通常具有序列重复性高、高亲水性与带电性及编码基因序列简单的结构特征,同时还具有易结合、空间优越性和高度协调性的生物学优势。无序蛋白质的发现是对传统的蛋白质“序列-结构-功能”范式的挑战
天然无序蛋白(IDPs)和内在无序区域(IDRs)是在生理条件下观察到的一种有趣的动态构象集合。它们通过不同于它们的结构对应物的机制促进了各种各样的生物过程。内在无序通过协同分子识别、翻译后修饰和可变剪接实现复杂的调控。对IDRs的广泛分析揭示了它们在分子识别和细胞调控中的核心作用。IDRs多样的生物物理性质补充了IDRs的多种功能。在无序的单一名称下,存在着多种蛋白质状态,这些状态在不同的蛋白质之间或同一蛋白质在不同的生物环境中有所不同。
一个给定的蛋白质可能有一个、多个或没有IDRs,在某些情况下,整个蛋白质本质上是无序的。例如,蛋白Bcl-xL的X射线晶体结构有几个内在无序的区域。像许多蛋白质。Bcl-xL在其C末端有一个IDR。通常,终端IDR的长度可以有很大的不同,从几个到几百个残基,并且可以同时存在于两端。Bcl-xL在其结构化域范围内也有一个较大的IDR。这些区域或紊乱区域在长度上也可能有很大差异。虽然他们都典型地比末端无序区域更短,长度上似乎没有物理上的限制。另一个可能的IDRs的序列位置在结构域之间,即所谓的连接器区域。连接子可以是任何长度,从只有几个残基到几百个或上千个残基,就像BRCAl一样,它在其N和C端有1500个残基无序区域连接着有序结构域。
IDRs通过不同于其结构化副本的机制实现了各种各样的生物过程。将蛋白质功能与内在无序区相关联的广泛分析揭示了IDRs在分子识别和细胞调控方面的核心作用。通常,结构区域和无序区域协同工作,就像lac抑制子的情况一样。内在无序通过协同分子识别实现了复杂的调控、翻译后修饰和可变剪接。Nfat蛋白家族就是这一现象的例证。内在无序区也在中枢细胞调控的抑制和解除抑制中发挥重要作用,这是p27和相关蛋白的典范。IDRs的多种生物物理特性使其具有多种功能。虽然所有IDRs的相似之处在于他们缺乏内在稳定结构,但是IDRs的生物物理性质却各不相同。IDRs的生物物理和功能特性反映在其组成、序列复杂性和保存性等方面。这些序列特性已经被用于设计算法,可以直接从蛋白质序列准确预测内在无序区和无序区的某些分子功能。
《天然无序蛋白质:动力学,结合和功能》一书于2019年由Academic Press出版,作者是:Nicola Salvi。
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本书目录:
致谢者名单
前言
第1章 介绍天然无序蛋白和区域
Christopher
J. Oldfield, Vladimir N. Uversky, A. Keith Dunker, Lukasz Kurgan
第一部分:方法论
第2章IDPs和IDRs的集成描述:集成仿真和实验
Nicola
Salvi
第3章 核磁共振对IDPs和IDRs动力学的实验表征
Nicolas
Bolik-Coulon, Guillaume Bouvignies, Ludovic Carlier, Fabien Ferrage
第4章 IDPs和IDRs的单分子荧光研究
Wenwei
Zheng and Hoi Sung Chung
第二部分:分子机制
第5章 天然无序蛋白质与其伴侣蛋白结合的实验研究
Robert
Schneider, Malene Ringkjøbing Jensen and Martin Blackledge
第6章 用天然无序蛋白质建模蛋白质之间的相互作用
Charles
W. Christoffer and Daisuke Kihara
第三部分:生物学和医学
第7章 生物分子凝聚物中的IDPs和IDRs
Alex
S. Holehouse
第8章 IDPS纤维性颤动的分子机制
Nicola
Salvi
第9章 基于IDPs的药物发现策略展望
Gustavo
Fuertes, Laura Nevola and Santiago Esteban-Martín
第10章 结论和未来的方向
Nicola
Salvi
索引
胡萌欣 武汉大学生命科学学院 博士