bioinformatics --a practical approach

生物信息学——介绍一种实用的方法

作者：Shui Qing Ye

出版：CRC press

索书号：Q811.4/Y37/2019/Y

ISBN: 978-0-36738-875-1

藏书地点:武大外教中心

生物信息学是一个新兴的，不断发展的科学分支，它为将生物信息分发到包括国家生物技术信息中心在内的各种生物数据库中的爆炸式增长铺平了道路。为了在该领域继续发展，生物学家必须掌握基本的计算机技能，而计算机专家必须对生物学问题有基本的了解。为了弥合生物学与计算机科学之间的鸿沟，《生物信息学：一种实用方法》将与组学时代相关的当前生物信息学知识和工具整合为一个统一，简洁且自成体系的书。

这本实用的书由来自世界各地的专家撰稿，介绍了最先进的生物信息学应用程序。第一部分着重于基因组分析，常用的DNA分析工具，系统发育分析以及SNP和单倍型分析。在有关微阵列，SAGE，基因表达的调控，miRNA和siRNA的章节之后，该书介绍了在蛋白质组分析，蛋白质序列，蛋白质功能以及鼠模型中蛋白质的功能注释方面广泛应用的程序和工具。最后一部分介绍了生物学，网站和数据库设计中使用的编程语言，以及Microsoft Excel和Access之间的数据交换。本书尽量减少复杂的数学推论和术语，为生物信息学提供了理论基础和实际应用。

生物信息学是一种实用方法，通过分步说明和示例展示快速有效的应用程序。本书每章都有概述，展示了如何从基因组学，转录组学，蛋白质组学和其他集成数据库中筛选出感兴趣的基因，并展示了如何检索单核苷酸多态性和单倍型数据。该书还介绍了DNA和蛋白质序列分析中的各种程序和工具，并介绍了基本的生物计算工具。还涵盖了小鼠数据库的挖掘。除了示例数据集以及有用的网站和数据库列表之外，该资源还具有该领域领先的国际专家的贡献。

使用生物信息学预测蛋白质结构可能涉及序列相似性搜索，多个序列比对，结构域的鉴定和表征，二级结构预测，溶剂可及性预测，自动蛋白质折叠识别，构建原子细节的三维模型以及模型验证。并非所有的蛋白质结构预测项目都涉及所有这些技术的使用。典型的蛋白质结构预测的核心部分是确定合适的结构靶标，从中可以推断出查询序列的三维信息，完成的方式定义了三种类型的项目。首先涉及标准和易于理解的技术的使用。如果由于从非平凡的数据分析中获得不一致的结果而无法可靠地确定目标，则该项目属于第三类项目，并且几乎不可能以任何程度的可靠性完成。在本文中，提出了一套从序列预测蛋白质结构的协议，并给出了三种类型的项目之间的区别。这些方法，如果使用得当，可以提供有价值的蛋白质结构和功能指标。

《生物信息学》一书于2019年由CRC press 出版，作者是Shui Qing Ye。

《生物信息学》一书中，研究人员介绍了生物信息学的技术和方法，重点是最近的技术发展，讨论的主题主要包括四个部分，包括基因组和DNA序列分析、转录组和RNA序列分析、蛋白质组和蛋白质序列分析、基本的生物计算工具。《生物信息学》一书从各个方面讲解了生物信息学的基础内容和研究方法，旨在为想要进一步研究生物信息学的研究人员提供简明易懂的介绍以及方法技术指导。

《生物信息学》一书作为计算机科学和生物学相结合的专业研究读物，观点新颖独到，内容饱满详实、语言浅显易懂，除此之外，还包括一些其他的特点：

1、本书分为四个章节，既讲解了生物信息学过程的基础知识，还讲解了深入研究生物信息学，是一本应用性很强的书籍，对于想要学习如果研究生物信息学的研究人员来说是一本很有意义的指导书籍。

2、每个章节都是由相关领域的专业人士所撰写，因此，本书讲解既详细又专业，作者能够从中了解到生物信息学相关的专业知识以及最新的前沿进展。

总的说来，《生物信息学》一书为想要了解生物信息学研究方法的人员提供了清晰的导读路径，作为生物信息学领域的一本前沿研究图书，是一本值得为想要涉足该领域的人员推荐的专业书籍。

关于作者：

Dipak K. Dey是康涅狄格大学的教授兼统计系主任。

Samiran Ghosh是印第安纳大学-普渡大学数学科学系的助理教授。

Bani K. Mallick是德克萨斯A＆M大学的统计学教授和贝叶斯生物信息学实验室主任。

本书目录：

基因组和DNA序列分析

转录组和RNA序列分析

蛋白质组和蛋白质序列分析

基本的生物计算工具

附录

指数

林岚 武汉大学生命科学学院 博士研究生