临床DNA变异解读:理论与实践
Clinical DNA Variant Interpretation: Theory and Practice
作者:Conxi Lázaro, Jordan Lerner-Ellis, Amanda Spurdle
出版:Academic Press
ISBN: 978-0-12-820519-8
藏书地点:武大外教中心
医学遗传学是近三十年来快速发展的一个领域,包括临床遗传学,遗传咨询,分子遗传学、细胞遗传学和生化遗传学等多个亚专业。所有这些都被应用于多个不同的疾病专业领域。医学遗传学亦称人类遗传学,是医学与遗传学相结合的一门边缘学科,是遗传学知识在医学领域中的应用。而医学遗传学的理论和实践又丰富和发展了遗传学。医学遗传学的研究对象是人类。人类遗传学(human genetics)探讨人类正常性状与病理性状的遗传现象及其物质基础。而医学遗传学则主要研究人类(包括个体和群体)病理性状的遗传规律及其物质基础。医学遗传学通过研究人类疾病的发生发展与遗传因素的关系,提供诊断、预防和治疗遗传病和与遗传有关疾病的科学根据及手段,从而对改善人类健康素质作出贡献。
医学遗传学不仅与生物学、生物化学、微生物及免疫学、病理学、药理学、组织胚胎学、卫生学等基础医学密切有关,而且已经渗入各临床学科之中。研究临床各种遗传病的诊断、产前诊断、预防、遗传咨询和治疗的学科称为临床遗传学(clinical genetics)。
人类基因组计划于2003年完成,新技术现在可以以不到1000美元的价格对整个基因组进行测序,这开启了基因检测的新时代,包括Panel、外显子组和基因组测序。常见和罕见的变异都存在。不幸的是,我们现在测序人类基因组的速度已经超过了我们解释它的能力,这是未来的一大挑战。
人类基因组计划(Human Genome Project)估计,人类大约有21000个蛋白质编码基因。新的基因疾病关联不断被发现,截至2020年8月28日,人类基因和遗传表型综合汇编(《人类孟德尔在线遗传》(OMIM)共登记了4316个导致表型的基因改变,这些基因往往包含在诊断Panel或临床外显子组中。然而,每个基因组有近30亿对碱基对,每个人有超过500万个常见和罕见的DNA变异,了解这些变异对人类表型的影响仍然是一项巨大的事业。
这本教科书代表了在变异解释上为临床医生和分子科学家的一个高度最新的资源。这本书也将是一个伟大的起点,从研究生和硕士学生到感兴趣的公众,谁想要或需要了解更多关于DNA变异的解释,以及他们如何可以被分类为疾病相关或不相关的群体。直到最近5年甚至是现在,基于硅分析和剪接预测工具的证据相当脆弱,在发表的手稿中,变异经常被错误地报道为致病的,剪接预测工具有很大的错误率。这不是一件小事。错误地将一种变异归类为致病性或可能致病性,会导致那些使用该测试来预测疾病的人采取激烈的行动。
在乳腺癌/卵巢癌易感基因BRCAI中有一个明显的剪接变体, 由于它位于典型剪接区域的(-2)位置,被错误地报道为致病。这导致携带该变异基因的女性进行了降低风险的乳房切除手术,因为携带该变异基因的女性不会面临高风险。
本书从如何使用计算和功能的证据,特别是对癌症易感性的体细胞数据的解释,它涵盖了所有的基础。它强调了临床表型的重要性,以及在一些具有相同罕见单基因综合征障碍的家庭中发现的罕见变异是一个有用的工具。 此外,研究RNA对解释潜在的剪接变异和产生的蛋白质产物的潜在破坏的重要性。它甚至提供了一个重要的章节,关于药物遗传学和个性化医学,这是拯救生命和预防疾病的一个至关重要的领域。建立了变异解释的框架之后,这本书提供了关于变异的目体例子如何在不同的疾病领域分类的章节。这些疾病包括心脏病、先天性代谢障碍(苯丙酮尿症)、听力丧失障碍、高胆固醇血症和癌症易感体质,最后是RASopathy。
这本书的目的是提供一个对DNA变异如何解释和分类的全面的理论和实践的理解以及临床应用。它是为广大受众设计的,从研究生和硕士学生到临床医生,调查人员,或希望学习如何对DNA变异数据进行不同的解释的行业员工。包括如今使用的前沿技术方法以及如何应用它们。
《临床DNA变异解读:理论与实践》一书于2021年由Academic Press出版,作者为Conxi Lázaro, Jordan Lerner-Ellis和Amanda Spurdle。
《临床DNA变异解读:理论与实践》一书,作者展现了医学遗传学中病理条件下DNA变异数据的解读的一些最新知识,讨论的主题主要包括四部分,前言,理论性章节,实践性章节以及结论。
《临床DNA变异解读:理论与实践》是医学生物学实验室不可或缺的工具用书,适用于医学遗传学等相关专业的研究人员参考。
《临床DNA变异解读:理论与实践》一书作为医学遗传学专业研究读物,内容饱满详实、语言浅显易懂,除此之外,还包括一些其他的特点:
1. 这本书是一本综合性的书籍,介绍了如何使用计算和功能的证据,特别是对癌症易感性体细胞数据的解释,它涵盖了所有的基础理论知识。本书还强调了临床表型的重要性,以及在一些具有相同罕见单基因综合征障碍的家庭中发现的罕见变异。它甚至提供了关于药物遗传学和个性化医学的介绍,这是拯救生命和预防疾病的一个至关重要的领域。建立了变异解释的框架之后,这本书提供了关于变异的具体例子,及其如何在不同的疾病领域中分类,这些疾病包括心脏病、先天性代谢障碍(苯丙酮尿症)、听力丧失障碍、高胆固醇血症和癌症易感体质,最后是RASopathy综合征。
2. 这本书的目的是提供一个对DNA变异如何解释和分类的全面的理论和实践的理解以及临床应用。它是为广大受众设计的,从研究生和硕士学生到临床医生,调查人员,或希望学习如何对DNA变异数据进行不同的解释的行业员工。包括如今使用的前沿技术方法以及如何应用它们。
3.本书图表丰富,读者能够结合清晰的图表更加清楚的理解相关的知识。
总的说来,《临床DNA变异解读:理论与实践》一书为想要了解医学遗传学中遗传变异的解读与应用的人员提供了清晰的导读路径,作为医学和遗传学领域的一本前沿研究图书,是一本值得为想要涉足该领域的人员推荐的专业书籍。
本书目录:
撰稿者名单
前言:对变异解读的挑战
关于编者
1. 引言:基因组DNA解读的挑战
第一部分 理论章节
2. 一般注意事项:术语和标准
3. 宪法顺序变式解释的国际共识准则
4. 量化建模:数据的多因素整合
5. 临床和遗传证据以及人口证据
6. 变量解释的计算方法:原理、结果和适用性
7. 功能证据(I)转录本和RNA剪接轮廓
8. 功能证据(II)蛋白质和酶功能
9. 体细胞资料在种系变异分类中的应用
10. 药物基因组学和个性化医疗
11. 数据共享和基因变异数据库
12. 全基因组尺度测序的综合解释方法
13. 表型评估和临床背景:病例水平数据在基因组变异解释中的应用
第二部分 实践章节
14. 遗传性心肌病
15. 苯丙酮酸尿
16. 听力损失
17. 家族性高胆固醇血症
18. 遗传癌基因变异的分类
19. RAS信号通路相关综合征
20. 摘要和结论
索引
胡萌欣 武汉大学生命科学学院 博士