Mechanistic
Enzymology: Bridging Structure and Function
出版社:ACS
Publications
索书号:Q55/M486/2020/Y
ISBN:9780841298842
藏书地点:武大外教中心
酶学是研究酶的化学本质、催化特性、生物学活性和生物学意义的一门分支学科。自1771年发现光合作用后,已经有无数科学家为酶学奋斗献身,已有6次诺贝尔奖与它的研究有关,但仍然没有完全揭开光合作用的谜底。虽然,我们无法用肉眼直接看到酶为植物建造的每一个绿色“工厂”,但无数个微型“工厂”却构成了世界上最大的利用光能的化工厂。据估计,地球上这些绿色“工厂”每年要消耗1500亿吨由二氧化碳提供的碳和250亿吨来自水的氢,贡献出4000亿吨氧气。酶是一种催化剂,这意味着它们不会成为终产物的组成部分。当生物化学反应结束后,只要将酶与反应产物分离,酶便能一次又一次地催化下一个相同的反应。在正常的情况下,只要有需要,酶就能不断地工作。与传统的化学反应相比,酶催化降低了反应的活化能,反应条件极其温和,不需要高温高压等剧烈的反应条件。酶反应的分子转化率高、专一性强,可获得高纯度的产品。
按化学组成不同,酶可分为单纯蛋白酶和结合蛋白酶两大类。单纯蛋白酶类分子仅含氨基酸;而结合蛋白酶类分子中除蛋白质(成为酶蛋白)外,还含有非蛋白质部分,后者常称为“辅助因子”,蛋白质部分称 “酶蛋白”,两者合并成“全酶”,全酶才具有催化活性。
辅助因子可以是金属离子,也可以是小分子有机化合物,后者根据其与酶蛋白结合紧密程度不同,又可分为辅酶与辅基两种。辅酶是指与酶蛋白以非共价结合的小分子有机物,因为结合疏松,故可用透析法分离两者,这是结合酶类中最多见的。辅基是指与酶蛋白结合较紧(一般为共价结合)的小分子有机化合物,故用透析方法不能使两者分离。辅酶(基)中往往含有B族维生素。
结合酶中,酶催化作用的专一性由酶蛋白部分决定;辅基辅酶的作用是在反应中起传递基团、原子和电子的作用。金属离子的作用是:有的是稳定酶蛋白分子的构象所必需,有的是组成酶的活性中心:有的是在酶与底物之间起桥梁作用,亦有的是中和阴离子,降低反应中的静电斥力。
许多蛋白水解酶在细胞内合成或初分泌时,只是酶的无活性前体,即酶原。如消化腺分泌的蛋白酶。参于血液凝固的酶和溶解纤维蛋白凝块的酶均以酶原形式存在,发挥作用前需先经过加工,即在一定条件下,使酶原转化成活性的酶,称酶原的激活。酶原激活的过程通常是在酶原分子中切除部分肽段,从而有利于酶活性中心的形成。以胰蛋白酶原激活为例,说明其激活机理及某些酶以酶原形式存在的临床意义。
酶法生产日用化学品中最具有代表性的是用细菌腈水合酶生产丙烯酰胺。丙烯酰胺是乙烯基系列聚合物的水溶性单体,由丙烯腈水合反应生成。丙烯酰胺的聚合物也是水溶性的,广泛应用于功能性聚合物的原料如纸张增强剂、高分子凝聚剂、石油回收剂等。丙烯酰胺交联聚合而成的凝胶状物具有非常强的吸水性,可望用于园艺和沙漠绿化,以促进植物的生长。
生物活性肽,特别是寡肽,在免疫调节、激素调节、酶抑制、抗菌、抗病毒等方面有广泛的应用前景,另外,调味肽在食品和药物生产上的商业潜力非常巨大。肽合成主要有3种方法:化学法、重组DNA技术和酶法。当前,在工业上采用最多的是化学法。酶法起步相对较晚,但其发展速度较快。因为在水相中肽键容易水解,导致副反应的产生,其次,作为底物的氨基酸衍生物在水相中的溶解度很低,随着非水相酶学的发展,阿斯巴甜、赖氨酸甜肽、血管紧张素、脑啡肽等寡肽的合成已获成功。
如今,在医药中间体和精细化工产品的生产中采用酶工艺的例子越来越多了,其中代表性的酶有蛋白酶、脂肪酶、酯酶、类固醇转化酶等等。以酶工艺取代原有的化学工艺或者以生物产品取代原有的化工产品,这将较大减少化学污染物的产生,减少原材料、能量和水的消耗,对环境和工业生产都是实实在在的大好事。
《酶学机制:桥接结构与功能》一书于2020年由ACS Publications出版社出版,作者是Jerry Taiwerr。酶学的机制是许多应用的基础,从药物设计到清洁产品,本书为生物化学家、结构生物学家和其他研究酶的人员理解酶的调节和功能提供了理论基础。本书也可以作为教学课本,向学生们介绍酶学机制相关的知识。
本书作为研究酶学机制的专业书记,内容专业详实,语言浅显易懂。除此之外本书还有以下特点:
1、本书不仅介绍了酶学机制的理论知识,还对桥接结构与功能进行了深入阐述,使读者能够更加全面的了解该领域的专业知识。
2、索引文献丰富,证明了这本书的知识性,真实性。而且,这些索引文献绝大部分都是最新研究,让读者全面了解该领域的前沿进展。
3、在本书的最后,将出现的专业词汇都罗列出来,大大方便了大家在阅读过程中对酶学机制研究的专业术语的认知。
4、本书最鲜明的特点就是图片生动形象,语言浅显易懂,语言介绍的同时,附上可以说明问题的图片,使得酶学相关专业知识变得简单易读,对初学者有很大的帮助。
本书目录
1. 导论:从多个视角看科学
2. 酶活性位点结构:整体大于部分之和
3. 综合结构生物学:使用X射线晶体学,小角度X射线散射,和低温电子显微镜来确定蛋白质结构
4. 构象动力学在理解基本生物分子行为中的演化作用
5. KatG结构与机制:利用蛋白质氧化对抗活性氧的威胁
6. 利用QM/MM模拟方法了解酶催化机理
7. 穿过屏障的隧道:解决由酶催化的C-H键激活的起源
8. Ideonella sakaiensis 201-F6中聚对苯二甲酸乙二醇酯水解酶PETase的合理蛋白工程研究
兰天 武汉大学生命科学学院 博士研究生