Statistical Genetics: Mapping, Linkage and Analysis

统计遗传学：映射、联系和分析

作者：Ivie Nathaniel

出版：Syrawood Publishing House

索书号：Q348/S797/2019/ Y

ISBN: 978-1-68286-722-8

藏书地点:武大外教中心

统计遗传学是一门科学学科，涉及开发用于分析遗传数据的统计方法。该领域通常与人类遗传学有关。它探索理论和方法，以支持人口遗传学，遗传流行病学和定量遗传学领域的研究。本书提供了该学科的重要信息，以帮助对统计遗传学和相关领域有很好的理解。详细研究了不断为该领域的发展做出贡献的各种研究。从事这一领域的遗传学家、分子生物学家、计算生物学家、研究人员和学生会发现这本书非常有益。

背景F2群体或杂交群体中的显性标记在排斥阶段比在耦合阶段具有更少的连锁信息。连锁分析产生两个独立的互补标记连锁图，在疾病关联分析和育种中几乎没有用处。需要开发有效的统计方法和计算算法来构建或合并完整的连锁主导标记图。这样做的关键是有效地估计排斥阶段主要标记之间的重组分数。结果我们提出一种期望最小二乘（ELS）算法和三点配子二项式分析（BAT），分别从F2显性和共显性标记数据估计配子频率。模拟和真实基因型数据集结果表明，ELS算法能够准确估计配子频率，在估计优势位点之间的重组分数和恢复6个优势位点在耦合和未知连锁阶段的真实连锁图方面优于EM算法。我们的BAT方法在估计两点重组分数方面的方差也比EM算法小。结论ELS是F2群体优势三位点系统中配子频率的准确估计方法，BAT是一种计算高效、快速的三点共优势配子频率估计方法。

尽管大多数高密度连锁图谱由于其高连锁信息而由单核苷酸多态性（SNP）和微卫星等共显性标记构建，但随着蛋白质组学技术广泛适用于从大样本中生成蛋白质多态性数据，预计显性标记将更加重要。然而，对于显性标记，一对标记之间的两个可能的连接阶段使标记之间重组分数的估计复杂化，从而使连锁图的构建复杂化。排斥期的低连锁信息和偶联期的高连锁信息促使遗传学家构建了两个独立但相关的连锁图谱。为了解决这个问题，我们提出了一种新的估计标记间复合分数的方法，通过区分链接位点的耦合阶段和排斥阶段，大大提高了估计的准确性。从真实和模拟的F2显性标记数据中获得的结果表明，新方法估计的重组分数包含大量连接信息，用于构建完整的链接图。此外，新方法也适用于具有未知连锁阶段的混合类型标记（显性和共显性）的数据。

提出了一种构建综合遗传图谱的计算机化程序。计算机程序（Join Map）可以处理来自F2s，回交和重组近交系的原始数据，以及列出的成对重组频率。该程序对于合并在不同实验中收集的联系数据很有用;结果是不同遗传图谱的数学对齐。来自单个实验的数据也可以处理。鉴于分子标记的连锁信息量快速增长，通常由不同的研究小组产生，综合图谱提供了关于基因和DNA标记图谱位置的有用信息。

《统计遗传学：映射、联系和分析》一书于2019年由Ivie Nathaniel出版，作者是Claudio Cobelli and Ewart Carson。

《统计遗传学：映射、联系和分析》一书中，研究人员介绍了统计遗传学的基本概念，重点是最近的技术发展，讨论的主题主要包括十三个章节。《统计遗传学：映射、联系和分析》一书从各个方面讲解了统计遗传学的基础内容和研究方法，旨在为想要进一步研究统计遗传学的研究人员提供简明易懂的介绍以及方法技术指导。

《统计遗传学：映射、联系和分析》一书作为统计遗传学专业研究读物，观点新颖独到，内容饱满详实、语言浅显易懂，除此之外，还包括一些其他的特点：

1、本书分为十三个章节，既讲解了统计遗传学的基础知识，还讲解了深入研究统计遗传学的应用范围，是一本应用性很强的书籍，对于想要学习研究统计遗传学的研究人员来说是一本很有意义的指导书籍。

2、每个章节都是由相关领域的专业人士所撰写，因此，本书讲解既详细又专业，读者能够从中了解到统计遗传学相关的专业知识以及最新的前沿进展。

总的说来，《统计遗传学：映射、联系和分析》一书为想要了解统计遗传学的研究方法的人员提供了清晰的导读路径，作为统计遗传学领域的一本前沿研究图书，是一本值得为想要涉足该领域的人员推荐的专业书籍。

本书目录：

第一章子宫内母体吸烟暴露与DNA甲基化相关发育中的胎儿大脑中神经元含量的改变和减少

Zac Chatterton, Brigham I. Hartlev, Man-Ho Seok,kic, Gorazd Rosoklija, Aleksandar Stankov, Gorazd Rosoklija,Aleksandar Stankov，Iskra Trencevsia-Ivanovska,Kristen Brennand,Andrew J.Dwork,Fatemeh Haghighi

第二章CpGdyads的不对称DNA甲基化是次级D的一个特征。

Megan Guntrum,Ekaterina Vlasova,Tamara L.Davis

第三章在基因组范围内搜索zelda样染色质特征识别GAF。

Arbel Moshe and Tommy Kaplan

第四章维生素C诱导小鼠胚胎中H3K9me2特异性的去甲基化

Kevin T. Ebata, Kathryn Mesh, Shichong Liu, Misha Bilenky, Alexander Fek

第五章中国汉族人群常见的个体间DNA甲基化差异区域

Christopher Schroder, Elsa Leitao, Stefan Wallner, Gerd SchmitzLudger Klein-Hitpass, Anupam Sinha, Karl-Heinz JockeStefanie Heilmann-Heimbach, Per Hoffmann, Markus M. NothenMichael Steffens, Peter Ebert, Sven Rahmann and Bernhard Horsthemke

第六章调节hsp70转录过程中组蛋白H3K4和H3K27的三甲基化水平

Taosui Li, Jacob W.Hodgson, Svetlana Petruk, Alexander Mazo anHugh W. Brock

第七章低甲基化结构域富集的DNA基序为可及序列的前图案

Ryohei Nakamura, Ayako Uno, Masahiko Kumagai, Shinichi Morishita ancHiroyuki Takeda

第八章组蛋白亚型H2A1H促进达到不同的生理状态通过改变染色质动力学

Raja Reddy, Kakoli Bose, Uddhavesh Sonavane, Rajendra Joshi ,Sanjay Gupta

第九章有丝分裂后状态建立和维持过程中染色质组织的变化

Yiqin Ma and Laura Buttitta

第十章组蛋白H1磷酸化在多能性细胞分化中的位点特异性调控

Ruiqi Liao and Craig A. Mizzen

第十一章哥斯达黎加高地长骨区DNA甲基化和淋巴细胞比例的差异

M.Morin,Rachel D.Edgar, Julia L.MacisacMeaghan J. Jones, William H. Dow, Luis Rosero-Bixby, Michael S. Kobor ancDavid H. Rehkopf

第十二章人类基因组中DNA甲基化与核小体占用的关系

Clayton K. Collings and John N. Andersor

第十三章与α地中海贫血/精神发育迟滞x连锁综合征相关的表观遗传特征鉴定melaila C. Schenkel, Kristin D. Kernohan, Arran McBride, Ditta Reina,Amanda Hodge, Peter J. Ainsworth, David I. Rodenhiser, Guillaume Pare,Nathalie G. Berube, Cindy Skinner, Kym M. Boycott, Charles Schwartz,bekim Sadikovic

林岚武汉大学生命科学学院博士研究生